Οι μαθητές του Γυμνασίου Ν. Αγιονερίου προέρχονται ως επί το πλείστον από τα δημοτικά διαμερίσματα Νέου Αγιονερίου, Παλαιού Αγιονερίου, Μικρόκαμπου και Ανθόφυτου.
Το σχολείο κατα το τρέχον σχολικό έτος διαθέτει ένα τμήμα πρώτης γυμνασίου, ένα τμήμα δευτέρας και δύο τμήματα τρίτης γυμνασίου.